python实现泊松回归

1 什么是基于计数的数据?

基于计数的数据包含以特定速率发生的事件发生率可能会随着时间的推移或从一次观察到下一次观察而发生变化。以下是基于计数的数据的一些示例:

  • 每小时穿过十字路口的车辆数量
  • 每月去看医生的人数
  • 每月发现的类地行星数量

计数数据集具有以下特征:

  • 整数数据:数据由非负整数组成:[0… ∞] 。普通最小二乘回归等回归技术可能不适合对此类数据进行建模,因为 OLSR 最适合实数,例如 -656.0、-0.00000345、13786.1 ETC。
  • 偏斜分布:数据可能包含少量值的大量数据点,从而使频率分布相当偏斜。请、参见上面的直方图示例。
  • 稀疏性:数据可能反映了伽马射线爆发等罕见事件的发生,从而使数据变得稀疏。
  • 发生率:为了创建模型,可以假设事件 λ 有一定的发生率来驱动此类数据的生成。事件发生率可能会随着时间的推移而发生变化。

下表包含在纽约市各桥梁上骑行的骑自行车者的计数。从2017年4月1日到2017年10月31日,每天都会测量计数。

以下是布鲁克林大桥上骑自行车的人计数的时间顺序图:

2 计数回归模型

泊松回归模型负二项式回归模型是开发计数回归模型的两种流行技术。其他可能包括有序 Logit、有序 Probit 和非线性最小二乘模型

最好从泊松回归模型开始,并将其用作更复杂或约束较少的模型的“控制”。卡梅伦和特里维迪在他们的**《计数数据回归分析》**一书中说道:

“一个合理的做法是估计泊松模型和负二项式模型。”

在本节中,将使用泊松回归模型对布鲁克林大桥上观察到的骑自行车者计数进行回归。

3 泊松模型简介

泊松分布具有以下概率质量函数。

泊松分布的期望值(平均值)是 λ。因此,在缺乏其他信息的情况下,人们应该期望在任何单位时间间隔(例如 1 小时、1 天等)内看到 λ 事件。对于任何时间间隔 t,人们都期望看到 λt 事件。

  1. 常数 λ 的泊松回归模型

如果事件发生率 λ 是恒定的,则可以简单地使用修改的平均模型来预测未来的事件计数。在这种情况下,可以将所有计数的预测值设置为该恒定值 λ

下图说明了常数 λ 的场景:

  1. 非常数 λ 的泊松回归模型

检查一种更常见的情况,其中 λ 可以从一个观察值更改为下一个观察值。在这种情况下,假设 λ 的值受到解释变量向量(也称为预测变量、回归变量或回归变量)的影响,将这个回归变量矩阵称为 X

回归模型的作用是将观察到的计数 y 拟合到回归值矩阵 X 。

在纽约市骑自行车者计数数据集中,回归变量为日期、星期几、高温、低温和降水量。还可以引入额外的回归量,例如从日期派生的月份和日期,并且可以自由地删除现有的回归量,例如日期:

y 与 X 的拟合是通过固定回归系数 β 向量的值来实现的。

在泊松回归模型中,事件计数 y 被假定为泊松分布,这意味着观察 y 的概率是事件率向量 λ 的函数

泊松回归模型的工作是通过链接函数将观测计数 y 拟合到回归矩阵 X,该链接函数将速率向量 λ 表示为回归系数 β 和 回归矩阵 X 的函数

下图说明了泊松回归模型的结构。

将 λ 与 X 连接起来的良好链接函数 f(.) 是什么?事实证明,以下指数链接函数效果很好:

即使当回归量 X 或回归系数 β 具有负值时,该链接函数也使** λ 保持非负值**。这是基于计数的数据的要求。

一般来说,有:

4 泊松回归模型的形式化说明

基于计数的数据的泊松回归模型的完整规范如下:

对于数据集中由 y_i 表示的与回归变量 x_i 行对应的第 i 个观测值,观测计数 y_i 的概率是按照以下 PMF 的泊松分布:

其中第 i 个样本的平均速率 λ_i 由前面所示的指数链接函数给出。在这里重现它:

一旦模型在数据集上得到充分训练,回归系数 β 就已知,模型就可以进行预测了。为了预测与观察到的回归量 x_p 输入行相对应的事件计数 y_p,可以使用以下公式:

所有这些都取决于成功训练模型的能力,以便已知回归系数向量 β。

接下来看看这个训练是如何进行的。

5 训练泊松回归模型

训练泊松回归模型涉及查找回归系数 β 的值,这将使观察到的计数 y 的向量最有可能。

识别系数 β 的技术称为最大似然估计 (MLE)。

使用骑自行车者计数数据集来说明 MLE 技术。看一下该数据集的前几行:

假设红框中显示的骑自行车者计数来自泊松过程。因此可以说它们发生的概率是由泊松 PMF 给出的。以下是前 4 次出现的概率:

可以类似地计算训练集中观察到的所有 n 个计数的概率。

注意,在上面的公式中,λ_1,λ_2,λ_3,…,λ_n是使用link函数计算的,如下所示:

其中 x_1、x_2、x_3、x_4 是回归矩阵的前 4 行。

训练集中 n 个计数 y_1, y_2,…,y_n 的整个集合出现的概率是各个计数出现的联合概率

计数 y 服从泊松分布,y_1, y_2,…,y_n 是独立的随机变量,相应地给出 x_1, x_2,…,x_n。因此,y_1、y_2、…、y_n 出现的联合概率可以表示为各个概率的简单乘法。以下是整个训练集的联合概率:

让我们回想一下,λ_1、λ_2、λ_3、…、λ_n 通过回归系数 β 链接到回归向量 x_1、x_2、x_3、…、x_n。

β 的什么值将使给定的观察计数 y 集最有可能出现?它是上式中所示的联合概率达到最大值时的β值。它是 β 的值,其中联合概率函数的对β的变化率为 0。换句话说,它是通过对联合概率方程对 β 进行微分而得到的方程的解并将该微分方程设置为 0。

联合概率方程的对数微分比原方程更容易。对数方程的解产生相同的 β 最优值。

这个对数方程称为对数似然函数。对于泊松回归,对数似然函数由以下等式给出:

上式是将前面所示的联合概率函数两边取自然对数,并将 λ_i 替换为 exp(x_i*β) 后得到的。

如前所述,对数似然方程对 β 进行微分,并将其设置为零。这个运算提供了以下等式:

求解回归系数 β 的方程将得到 β 的最大似然估计 (MLE)。

为了求解上述方程,使用迭代方法,例如迭代重加权最小二乘法 (IRLS)。

6 执行泊松回归的步骤摘要

总之,以下是对基于计数的数据集执行泊松回归的步骤:

  • 首先,确保数据集包含计数。一种判断方法是它仅包含非负整数值,表示某个时间间隔内某个事件发生的次数。在骑自行车者计数数据集中,它是每天穿过布鲁克林大桥的骑自行车者的数量。
  • 找出(或猜测)会影响观察到的计数的回归变量。在骑自行车者计数数据集中,回归变量包括星期几、最低气温、最高气温、降水量等。
  • 制定回归模型将用于训练的训练数据集,以及应保留的测试数据集。不要根据测试数据训练模型。
  • 使用合适的统计软件(例如 Pythonstatsmodels 包)在训练数据集上配置和拟合泊松回归模型。
  • 通过在测试数据集上运行模型来测试模型的性能,以生成预测计数。将它们与测试数据集中的实际计数进行比较。
  • 使用拟合优度度量来确定模型在训练数据集上的训练效果。

7 如何在 Python 中训练泊松回归模型

目标是为观察到的骑车人计数 y 建立泊松回归模型。将使用经过训练的模型来预测模型在训练期间未见过的布鲁克林大桥上每日骑自行车的人数。

首先导入所有必需的包。

import pandas as pd
from patsy import dmatrices
import numpy as np
import statsmodels.api as sm
import matplotlib.pyplot as plt

为计数数据集创建一个 pandas DataFrame。

df = pd.read_csv('nyc_bb_bicyclist_counts.csv', header=0, infer_datetime_format=True, parse_dates=[0], index_col=[0])

我们将向 X 矩阵添加一些导出的回归变量。

ds = df.index.to_series()
df['MONTH'] = ds.dt.month
df['DAY_OF_WEEK'] = ds.dt.dayofweek
df['DAY'] = ds.dt.day

我们不会使用 Date 变量作为回归量,因为它包含绝对日期值,但我们不需要做任何特殊的事情来删除 Date,因为它已经被用作 pandas DataFrame 的索引。所以它在 X 矩阵中对我们来说是不可用的。

让我们创建训练和测试数据集。

mask = np.random.rand(len(df)) < 0.8
df_train = df[mask]
df_test = df[~mask]
print('Training data set length='+str(len(df_train)))
print('Testing data set length='+str(len(df_test)))

以 Patsy 表示法设置回归表达式。BB_COUNT 是因变量,它取决于回归变量:DAY、DAY_OF_WEEK、MONTH、HIGH_T、LOW_T 和 PRECIP。

expr = “”“BB_COUNT ~ DAY + DAY_OF_WEEK + MONTH + HIGH_T + LOW_T + PRECIP”“”

为训练和测试数据集设置 X 和 y 矩阵。 Patsy 让这一切变得非常简单。

y_train, X_train = dmatrices(expr, df_train, return_type='dataframe')
y_test, X_test = dmatrices(expr, df_test, return_type='dataframe')

使用 statsmodels GLM 类,在训练数据集上训练泊松回归模型。

poisson_training_results = sm.GLM(y_train, X_train, family=sm.families.Poisson()).fit()

打印总结。

print(poisson_training_results.summary())

这会打印出以下内容:

那么模型表现如何?对测试数据集做一些预测。

poisson_predictions = poisson_training_results.get_prediction(X_test)
#summary_frame() returns a pandas DataFrame
predictions_summary_frame = poisson_predictions.summary_frame()
print(predictions_summary_frame)

以下是输出的前几行:

绘制测试数据的预测计数与实际计数。

predicted_counts=predictions_summary_frame['mean']
actual_counts = y_test['BB_COUNT']
fig = plt.figure()
fig.suptitle('Predicted versus actual bicyclist counts on the Brooklyn bridge')
predicted, = plt.plot(X_test.index, predicted_counts, 'go-', label='Predicted counts')
actual, = plt.plot(X_test.index, actual_counts, 'ro-', label='Actual counts')
plt.legend(handles=[predicted, actual])
plt.show()

这是输出:

该模型似乎或多或少地跟踪了实际计数的趋势,尽管在许多情况下其预测与实际值相差甚远。

绘制实际计数与预测计数的关系图。

plt.clf()
fig = plt.figure()
fig.suptitle('Scatter plot of Actual versus Predicted counts')
plt.scatter(x=predicted_counts, y=actual_counts, marker='.')
plt.xlabel('Predicted counts')
plt.ylabel('Actual counts')
plt.show()

8 泊松回归模型的拟合优度

泊松分布的期望值(即均值)和方差均为 λ。大多数现实世界的数据都违反了这个相当严格的条件。

泊松回归模型失败的一个常见原因是数据不满足泊松分布规定的均值 = 方差标准。

statsmodels GLMResults 类上的 summary() 方法显示了一些有用的拟合优度统计数据,可帮助评估泊松回归模型是否能够成功拟合训练数据。

报告的偏差和皮尔逊卡方值非常大。考虑到这些值,几乎不可能实现良好的拟合。为了在某​​个置信水平(例如 95% (p=0.05))下定量确定拟合优度,在 χ2 表中查找 p=0.05 和残差自由度=163 的值。 (DF 残差 = 观察次数减去 DF 模型])。

将此卡方值与观察到的统计数据进行比较,在本例中为 GLMResults 中报告的偏差或皮尔逊卡方值。在 p=0.05 且 DF 残差 = 163 时,标准卡方表中的卡方值为 193.791,远小于报告的统计数据 23030 和 23300。

因此,根据此测试,泊松回归模型尽管展示了对测试数据集的“良好”视觉拟合,但与训练数据的拟合却相当差。

参考:
https://timeseriesreasoning.com/contents/poisson-regression-model/
https://omarfsosa.github.io/poisson_regression_in_python
https://scikit-learn.org/stable/modules/generated/sklearn.linear_model.PoissonRegressor.html
https://mengte.online/archives/12747

本文来自互联网用户投稿,该文观点仅代表作者本人,不代表本站立场。本站仅提供信息存储空间服务,不拥有所有权,不承担相关法律责任。如若转载,请注明出处:/a/509823.html

如若内容造成侵权/违法违规/事实不符,请联系我们进行投诉反馈qq邮箱809451989@qq.com,一经查实,立即删除!

相关文章

Mysql 常用SQL语句

1、查看mysql中所有的数据库&#xff0c; show databases; 2、创建库 create database 库名;&#xff08;也可以用 create database if not exists 库名; 表示如果库不存在再创建&#xff09; 例&#xff1a;create database if not exists ecology; 3、删除库 …

Linux安全加固

账号和权限 系统用户 超级管理员&#xff1a;UID0 系统默认用户&#xff1a;系统程序使用&#xff0c;从不登录 新增普通用户&#xff1a;UID大于500 用户管理 添加用户&#xff1a;useradd <用户名> 删除用户&#xff1a;userdel [-r] [-f] <用户名> 锁定/解…

electron 打包生成的latest.yml文件名字变成xxx.yml文件名

正常情况是electron每次打包会生成一个latest.yml文件和一个xxx.exe文件&#xff0c;但是当version的名字修改成 这样 后面添加了-beta &#xff0c;然后生成的文件名字就变成了 beta.yml 更改方法&#xff1a; 在build配置底下添加 "detectUpdateChannel": false…

我的C++奇迹之旅:值和引用的本质效率与性能比较

文章目录 &#x1f4dd;引用&#x1f320;引用概念&#x1f309;引用特性 &#x1f320;使用场景&#x1f309;做参数&#xff08;传值与传地址&#xff09;&#x1f309;传值、传引用效率比较 &#x1f320;引用做返回值&#x1f309;引用和指针的区别 &#x1f320;常引用&am…

坚持刷题|分发饼干

文章目录 题目思路代码实现实现总结主要步骤时间复杂度 扩展问题 Hello&#xff0c;大家好&#xff0c;我是阿月。坚持刷题&#xff0c;老年痴呆追不上我&#xff0c;今天刷第一个贪心算法&#xff1a;分发饼干 题目 455.分发饼干 思路 要解决这个问题&#xff0c;可以使用…

深度学习实战73-基于多模态CLIP模型的实战项目,CLIP模型的架构介绍与代码实现

大家好,我是微学AI,今天给大家介绍一下深度学习实战73-基于多模态CLIP模型的实战项目,CLIP模型的架构介绍与代码实现。多模态CLIP(Contrastive Language-Image Pre-training)模型是一种深度学习模型,其核心设计理念是通过大规模的对比学习训练,实现图像与文本之间的跨模…

Linux——进程管理

目录 作业和进程的概念 程序与进程的关系 查看进程信息——ps&#xff0c;top ps命令 top命令 设置进程的优先级——nice&#xff0c;renice nice命令 renice命令 查看进程信息——pgrep&#xff0c;pstree pgrep命令 pstree命令 切换进程——jobs&#xff0c;bg&a…

【linux】基础IO(一)

文件只有站在系统层面才能彻底理解 简单回顾一下文件&#xff1a; 首先我们要明确一点&#xff0c;我们说的打开文件不是写下fopen就打开文件&#xff0c;而是当我们的进程运行起来&#xff0c;进程打开的文件。 我们在C语言一般都会使用过如下的代码进行向文件中写入 但是除…

Oracle客户端如何连接远程数据库?

Oracle是一种常用的数据库管理系统&#xff0c;它具有高效、稳定的特性&#xff0c;广泛应用于各行各业。为了实现远程数据库的连接&#xff0c;我们可以使用Oracle客户端工具。本文将介绍如何使用Oracle客户端连接远程数据库&#xff0c;并讨论其使用场景。 Oracle客户端工具 …

sql中如何添加数据?

添加 在 SQL 中添加数据通常使用INSERT语句。INSERT语句用于将新的数据行插入到数据库表中。 基本的INSERT语句语法如下&#xff1a; INSERT INTO table_name (column1, column2,...) VALUES (value1, value2,...);其中&#xff1a; INSERT INTO&#xff1a;指定要插入数据…

利用Flutter的特性最大程度提升iOS应用的用户体验

本文探讨了使用Flutter开发的iOS应用能否上架&#xff0c;以及上架的具体流程。苹果提供了App Store作为正式上架渠道&#xff0c;同时也有TestFlight供开发者进行内测。合规并通过审核后&#xff0c;Flutter应用可以顺利上架。但上架过程可能存在一些挑战&#xff0c;因此可能…

SSM框架学习——MVC模式与三层架构

MVC模式与三层架构 什么是MVC模式 MVC模式代表Model-View-Controller&#xff08;模型-视图-控制器&#xff09;模式。这种应用模式用于应用程序的分层开发。 Model代表存取数据的对象&#xff0c;它自身可带有逻辑&#xff0c;数据变化时更新Controller。View代表Model包含…

最牛的音乐大模型-suno 音乐界的ChatGPT

一、前言 之前一直对音乐是无感的&#xff0c;但随着 suno.ai 大火&#xff0c;开始喜欢上了音乐&#xff0c;喜欢上了音乐创作的 二、suno介绍 2.1 基本介绍 基于 Suno 任何人都可以创作美妙音乐。无论您是歌手还是艺术家抑或是对音乐一无所知的人&#xff0c;suno都会打破…

STM32(1):系统架构地址映射

STM32&#xff08;1&#xff09;&#xff1a;系统架构&地址映射 前提摘要 个人说明&#xff1a; 限于时间紧迫以及作者水平有限&#xff0c;本文错误、疏漏之处恐不在少数&#xff0c;恳请读者批评指正。意见请留言或者发送邮件至&#xff1a;“Email:noahpanzzzgmail.com…

基因组Survey分析

流程图&#xff1a; 图片来源&#xff1a;https://www.jianshu.com/p/94da86093843 一、Fastp质控 二、NT比对 一般选择第六个输出格式 结果示例&#xff1a; 三、k-mer分析 软件&#xff1a;GCE/genomescope 分析目的&#xff1a;预估基因组大小&#xff0c;重复序列比…

团聚金刚石研磨液为高性能研磨抛光材料 中机新材是国内领先供应商

团聚金刚石研磨液为高性能研磨抛光材料 中机新材是国内领先供应商 团聚金刚石研磨液是一种高性能研磨抛光材料&#xff0c;是以团聚金刚石微粉为原料采用特殊配方配制而成。团聚金刚石微粉是由金刚石微粉、粘结剂经特殊工艺处理集合而成的球形磨料。金刚石微粉制备方式多样&am…

4年经验来面试20K的测试岗,一问三不知,我还真不如去招应届生。

公司前段缺人&#xff0c;也面了不少测试&#xff0c;结果竟然没有一个合适的。一开始瞄准的就是中级的水准&#xff0c;也没指望来大牛&#xff0c;提供的薪资在10-20k&#xff0c;面试的人很多&#xff0c;但平均水平很让人失望。看简历很多都是4年工作经验&#xff0c;但面试…

使用Java流API构建树形结构数据

简介&#xff1a; 在实际开发中&#xff0c;构建树状层次结构是常见需求&#xff0c;如组织架构、目录结构或菜单系统。本教案通过解析给定的Java代码&#xff0c;展示如何使用Java 8 Stream API将扁平化的菜单数据转换为具有层级关系的树形结构。 1. 核心类定义 - Menu Data…

中科驭数超低时延网络解决方案入选2023年度金融信创优秀解决方案

近日&#xff0c;由中国人民银行领导、中国金融电子化集团有限公司牵头组建的金融信创生态实验室发布「2023年度第三期金融信创优秀解决方案」&#xff0c;中科驭数超低时延网络解决方案从众多方案中脱颖而出&#xff0c;成功入选&#xff0c;代表了该方案的技术创新和金融实践…

Servlet基础 管理员注册页面

管理员注册页面 index.jsp <% page language"java" import"java.util.*" pageEncoding"UTF-8"%> <% String path request.getContextPath(); String basePath request.getScheme()"://"request.getServerName()":&quo…