内容如下:
1.外泌体和肝癌TCGA数据下载
2.数据格式整理
3.差异表达基因筛选
4.预后相关外泌体基因确定
5.拷贝数变异及突变图谱
6.外泌体基因功能注释
7.LASSO回归筛选外泌体预后模型
8.预后模型验证
9.预后模型鲁棒性分析
10.独立预后因素分析及与临床的相关性分析
11.列线图,ROC曲线,校准曲线,DCA曲线
12.外部数据集验证
13.外泌体模型与免疫的关系
14.外泌体模型与单细胞测序
############################ 03.差异表达基因筛选 ############################
下面我们用代码提取共同高表达和共同低表达的基因,然后绘制TCGA-LIHC的热图,准备的数据如下:
代码如下:
setwd("E:\\blog外泌体相关预测模型\\Figure 1\\heatmap")
## install.package("pheatmap")
LIHC <- read.csv(&#