外泌体相关基因肝癌临床模型预测——2-3分纯生信文章复现——03.差异表达基因筛选之热图绘制(4)

  

内容如下:

1.外泌体和肝癌TCGA数据下载

2.数据格式整理

3.差异表达基因筛选

4.预后相关外泌体基因确定

5.拷贝数变异及突变图谱

6.外泌体基因功能注释

7.LASSO回归筛选外泌体预后模型

8.预后模型验证

9.预后模型鲁棒性分析

10.独立预后因素分析及与临床的相关性分析

11.列线图,ROC曲线,校准曲线,DCA曲线

12.外部数据集验证

13.外泌体模型与免疫的关系

14.外泌体模型与单细胞测序

############################ 03.差异表达基因筛选 ############################

下面我们用代码提取共同高表达和共同低表达的基因,然后绘制TCGA-LIHC的热图,准备的数据如下:

代码如下: 


setwd("E:\\blog外泌体相关预测模型\\Figure 1\\heatmap")
## install.package("pheatmap")

LIHC <- read.csv(&#

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