在发表科研论文的过程中,科研绘图是必不可少的,一张好看的图形会是文章很大的加分项。
为了便于使用,本系列文章介绍的所有绘图都已收录到了 sciRplot 项目中,获取方式:
R 语言科研绘图模板 --- sciRplothttps://mp.weixin.qq.com/s/QA_8LVqjkdg4A16zLonw4w?payreadticket=HGQeBiaJqauYYGGWywwSwKJtFAcWdA4RVVwM576Plfv5WZIYwJNM2q7qtduEvpiIoSSZNnQ
本期绘图预览:
1. 导入包
我们首先导入本期绘图用到的 R 包:
library(ggplot2)
2. 准备数据
接下来我们导入绘图用到的数据,在 sciRplot 中给大家提供了测试数据:
data <- sciRplot_data
3. 准备配色
颜色的选择往往是一件让人特别纠结的事情,这里我们直接使用 sciRcolor 来设置配色:
colors <- sciRcolor::pal_scircolor(37)[1]
sciRcolor 是为了 R 语言科研绘图开发的配色工具,包含了 100 种常用配色,详细信息见:
R 语言科研配色工具 --- sciRcolorhttps://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzkwMjM0MzA5MA==&mid=2247488147&idx=1&sn=12fd884d3cfd9108b6a913fdb3647430&chksm=c0a7a24ef7d02b583c840b904d245c843f41ea8bc38ed41488405d0229ae61467828870ce236&payreadticket=HJnEK1iA0zGwNVbry3J6WgtTSjgUxty-aQ083Sy76r0Fa78A0tKn8r0PIryzsbuSgnbYhdw#rd
4. 绘制图形
接下来我们通过下面的代码来绘制图形:
p <-
ggplot(data, aes(x=date, y=unemploy, group=1)) +
geom_line(color=colors, size=2) +
geom_point(shape=21, color="black", fill=colors, size=6) +
labs(x="Date", y="Unemploy") +
scale_y_continuous(breaks=seq(2600,3200,100), limits = c(2600,3200),
expand = expansion(mult = c(0, 0.05))) +
theme_classic(base_size = 25) +
theme(panel.grid.major.y = element_line())
p
5. 保存图形
最后我们保存绘制的图形:
ggsave("save/line-base.png", p, width = 8, height = 6, dpi = 300)
sciRplot 介绍
为了解决 R 语言中科研绘图的问题,我推出了sciRplot 项目。sciRcolor 项目包含了以下内容:
① 100 种绘图代码,按照图形类型进行分类,包含 60 种基础绘图和 40 种进阶绘图
② 配备一站式 html文档,包含测试数据,代码一键复制,交互式阅读提高用户体验
注:本账号内所有原创内容,未经允许禁止转载和用于商业用途,违者必究。