机器学习|DBSCAN 算法的数学原理及代码解析
引言
聚类是机器学习领域中一项重要的任务,它可以将数据集中相似的样本归为一类。DBSCAN(Density-Based Spatial Clustering of Applications with Noise)
是一种是一种经典的密度聚类算法,它能够有效地发现任意形状的聚类簇,并且可以识别出噪声点。在本文中,我们将深入探讨DBSCAN
算法的数学原理,并提供Python
示例代码帮助读者更好地理解和应用该算法。
DBSCAN数学原理
基本思想
DBSCAN
算法通过定义样本点的邻域密度来划分簇,具体思想如下:
- 若一个样本点的邻域内包含足够数量的样本点,则将该点作为核心点,并以该点为中心形成一个新的簇。
- 若一个样本点的邻域内不包含足够数量的样本点,但存在某个核心点的邻域包含该点,则将该点归入该核心点所属的簇。
- 若一个样本点既不是核心点,也不能归入其他簇,则将其作为噪声点。
数学定义
DBSCAN
算法通过计算数据样本之间的密度来完成聚类任务。在介绍具体数学原理之前,我们先定义几个重要概念:
距离度量
:通常使用欧氏距离
或曼哈顿距离
来度量样本点之间的距离。
领域半径
:表示样本点在距离度量上的阈值,用于确定一个样本点的邻域
。
核心对象(Core Object)
:如果一个样本点周围的密度达到一定阈值(eps),则该样本点称为核心对象。
直接密度可达(Directly Density-Reachable)
:如果点p
在点q
的ε-
邻域内,并且点q
是核心对象,则点p
从点q
直接密度可达。
密度可达(Density-Reachable)
:对于点p
和q
,如果存在样本点序列p1, p2, ..., pn
,p1=p
,pn=q
,并且pi+1
从pi
直接密度可达,则点p
从点q
密度可达。
密度相连(Density-Connected)
:对于两个样本点p
和q
,如果存在样本点o
,使得点p
和点q
都从点o
密度可达,则点p
和点q
密度相连。
基于上述定义,DBSCAN
算法通过遍历数据集中的每个样本点,不断扩展核心对象的密度可达区域,最终将密度可达的样本点划分到同一个簇中,同时将噪声点单独归类。
DBSCAN算法流程
DBSCAN算法的具体流程如下:
- 初始化未访问
样本集合D
,将所有样本标记为未访问
。 - 从D中随机选择一个未访问样本点
p
。 - 若
p
为核心点,则创建一个新簇C
,并以p
为种子点开始扩展该簇。- 扩展方法:将
p
的直接密度可达样本点加入簇C
,并在其邻域内寻找其他核心点,递归地扩展簇C
。 - 若
p
不为核心点,则标记p
为噪声点。
- 扩展方法:将
- 重复步骤2和3,直到所有样本点都被访问或标记为噪声点。
DBSCAN示例代码
下面是使用Python
编写的一个简单的DBSCAN
示例代码:
import matplotlib.pyplot as plt
from sklearn.datasets import make_moons
from sklearn.cluster import DBSCAN
# 生成月亮形状的数据集
X, y = make_moons(n_samples=200, noise=0.05, random_state=0)
# 构建DBSCAN模型
dbscan = DBSCAN(eps=0.3, min_samples=5)
y_pred = dbscan.fit_predict(X)
# 绘制聚类结果
plt.scatter(X[:, 0], X[:, 1], c=y_pred, cmap='viridis')
plt.title('DBSCAN Clustering')
plt.show()
在示例代码中,我们使用 make_moons()
函数生成了一个月亮形状的数据集,其中包含200个样本点,并添加了一些噪声。然后,我们使用 DBSCAN()
构建了一个DBSCAN
聚类模型,并指定了 eps=0.3
和 min_samples=5
的参数。通过调用 fit_predict()
方法,我们将模型应用于数据集并得到聚类结果。
最后,我们使用 scatter()
函数将样本点绘制在二维平面上,并根据聚类结果进行着色。
输出图表
结语
通过本文,我们详细讲解了DBSCAN
算法的数学原理,并提供了一个简单的Python
示例代码展示了如何使用该算法进行聚类任务。希望本文能够帮助读者更好地理解DBSCAN
算法,并能够将其应用到实际问题中。
参考文献:
- Ester, M., Kriegel, H.P., Sander, J., & Xu, X. (1996). A density-based algorithm for discovering clusters in large spatial databases with noise. In Proceedings of the Second International Conference on Knowledge Discovery and Data Mining (KDD-96) (pp. 226-231).
- Schubert, E., Zimek, A., & Kriegel, H.P. (2017). Local outlier detection reconsidered: A generalized view on locality with applications to spatial, video, and network outlier detection. Data Mining and Knowledge Discovery, 31(3), 1-46.
- Campello, R.J.G.B., Moulavi, D., & Sander, J. (2013). Density-based clustering based on hierarchical density estimates. Data Mining and Knowledge Discovery, 27(3), 344-371.
- Zheng, Z., & Zhou, W. (2018). DBSCAN revisited: Mis-claim, un-fixability, and approximation. In Proceedings of the 28th International Conference on Scientific and Statistical Database Management (SSDBM-18) (pp. 31:1-31:12).
- Kriegel, H.P., Kroger, P., Schubert, M., & Zimek, A. (2011). Interpreting and unifying outlier scores. In Proceedings of the 11th SIAM International Conference on Data Mining (SDM-11) (pp. 13-24).