BioTech - 使用 Kubeflow 多机多卡 运行 高精度蛋白质结构的迭代预测

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Kubeflow

核心逻辑,参考:使用 循环(Recycle)迭代的蛋白质结构预测 获取 高精度结构

Kubeflow 是一个开源的 Kubernetes 原生框架,专注于简化、可移植和可扩展地在 Kubernetes 上部署机器学习(ML)工作流。其中,Kubeflow Pipelines,是一个用于构建和部署可移植且可扩展的 ML 工作流的平台,可以使用 Kubeflow Pipelines 来定义、运行和监控 ML 流程,包括数据预处理、模型训练、评估和部署。Kubeflow 使得在 Kubernetes 上部署 ML 工作流变得简单、自动化且可扩展。

在预测蛋白质的高精度三维结构时,需要循环进行预测,即预测的输出,作为下一次预测的输入,同时,也需要优化多个模版,因此,需要多机多卡,加速整个过程。通过,使用文件锁的方式,同时

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