1,是一种蛋白质中的规律性结构,motif
是DNA结合motif(和DNA结合的部分里的规律性结构)
形状类似手指
2,不仅能结合DNA、RNA,还能结合蛋白质、脂质等
3,经典结构例如C2H2:也称为Cys2His2,代表了最常见的一类,使用两个半胱氨酸和两个组氨酸来协同金属离子,并形成一个由β-折叠和α-螺旋组成的紧凑结构
经典的C2H2结构:
锌指结构由一个α-螺旋和两个反平行的β-折叠三个肽段组成(1个α-helix+2个反向平行的 β-sheet)
ββα
4,ZF蛋白有很多类:ZF蛋白家族
总体来说,人类蛋白质组中ZFP数量级大概在1700多个(2k左右数量级),
然后一些特定家族的ZFP数目,比如说C2H2等数量级会少点,大概在800左右(个人观点,需要进一步文献实证)
(1)折叠组Cys2His2:
(2)折叠组Gag-knuckle(堵嘴指节):
(3)折叠组Treble clef
(4)折叠组Zinc ribbon:
锌带折叠的特征是两个β-发夹形成两个结构相似的锌结合子位点。
(5)折叠组Zn2/Cys6:
此类的典型成员包含双核锌簇,其中两个锌离子由六个半胱氨酸 残基结合。这些锌指存在于多种转录因子中,包括酵母Gal4蛋白。
(6)折叠组TAZ2 域类似:
5,RNA结合方面:
总之ZF蛋白从蛋白角度出发,其结合DNA或RNA都可以从IDR等disorder角度去思考
参考:
https://mp.weixin.qq.com/s/uCpyxVQH_GthGQUodkzwzg