CtoUclassifier

一个基于机器学习和深度学习的Python包，用于纳米孔噪声衰减，有助于直接RNA测序实验中C-to-U编辑信号的改善。

所需软件:

C_to_U_classifiers 内部使用（且不限于）一些软件，建议在新conda环境中安装。
激活conda环境后，安装以下软件：

1. Python >= 3.7
2. f5c >= 0.7
3. Samtools >= 1.3.1
4. Minimap2 == 2.24
5. Guppy == 5.0.11（请参阅 https://community.nanoporetech.com/downloads 上的文档）

安装:

1. 从GitHub仓库下载源代码：

   https://github.com/F0nz0/C_to_U_classifier

2. 进入C_to_U_classifier文件夹并解压缩iForest_pretrained_model文件夹：

    tar -xf iForest_pretrained_model.tar.gz
   

3. 创建一个新的虚拟环境（建议创建、使用并激活一个包含所有所需软件的conda基础环境）：

    # 创建一个新的conda环境
    conda create --name CtoU python=3.8
   
    # 激活conda环境
    conda activate Cto