kraken2 最新版安装，极简模式

article2024/11/22 23:22:34/文章来源:https://blog.csdn.net/song5bai/article/details/138550072

kraken2

git clone https://github.com/DerrickWood/kraken2.git

cd kraken2

./install_kraken2.sh /opt/kraken

vim .bashrc
----------------
# Kraken
export PATH="/opt/kraken:$PATH"
----------------

source .bashrc

Note:
不晓得是不是我设置了清华源，导致conda 或者mamba都无法安装当前的最新版2.1.3，只能通过github的“install_kraken2.sh”安装。

conda install -c "bioconda/label/cf201901" kraken2

Reference

Manual · DerrickWood/kraken2 Wiki · GitHub

Kraken2+Bracken：宏基因组物种注释_kracken2配合bracken-CSDN博客

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