DeepPurpose 生物化学深度学习库；蛋白靶点小分子药物对接亲和力预测虚拟筛选

article2025/3/9 22:38:24/文章来源:https://blog.csdn.net/weixin_42357472/article/details/135445431

参考：
https://blog.csdn.net/c9Yv2cf9I06K2A9E/article/details/107649770
https://github.com/kexinhuang12345/DeepPurpose

##安装
pip install DeepPurpose rdkit

在这里插入图片描述

DeepPurpose包括：
数据：
关联TDC库下载，是同一作者开发的
https://blog.csdn.net/weixin_42357472/article/details/128081957

模型：
小分子表示方法
在这里插入图片描述

蛋白表示方法

蛋白靶点小分子药

本文来自互联网用户投稿，该文观点仅代表作者本人，不代表本站立场。本站仅提供信息存储空间服务，不拥有所有权，不承担相关法律责任。如若转载，请注明出处：/a/300990.html

如若内容造成侵权/违法违规/事实不符，请联系我们进行投诉反馈qq邮箱809451989@qq.com，一经查实，立即删除！

一、二进制方式安装部署K8S

目录一、操作系统初始化 1、关闭防火墙 2、关闭 SELinu 3、关闭 swap 4、添加hosts 5、同步系统时间二、集群搭建 —— 使用外部Etcd集群 1、自签证书 2、自签 Etcd SSL 证书 ① 创建 CA 配置文件：ca-config.json ② 创建 CA 证书签名请求文件&#xff…

Python3 字典

字典是另一种可变容器模型，且可存储任意类型对象。字典的每个键值 key>value 对用冒号 : 分割，每个对之间用逗号(,)分割，整个字典包括在花括号 {} 中 ,格式如下所示： d {key1 : value1, key2 : value2, key3 : value3 } 注…

[计算机提升] 设置文件关联程序

4.4 设置文件关联程序我们知道，系统是通过文件的后缀名来选择使用哪种程序来打开同一种类型的文件的。这个我们可以在选中文件后，点击鼠标右键，在弹出的菜单中选择属性： 可以在打开方式中看到默认是用记事本程序打开.docx文件…

【读书笔记】《白帽子讲web安全》跨站脚本攻击

目录前言： 第二篇客户端脚本安全第3章跨站脚本攻击（XSS） 3.1XSS简介 3.2XSS攻击进阶 3.2.1初探XSS Payload 3.2.2强大的XSS Payload 3.2.2.1 构造GET与POST请求 3.2.2.2XSS钓鱼 3.2.2.3识别用户浏览器 3.2.2.4识别用户安装的软…

【C++】STL 算法 ⑥ ( 二元谓词 | std::sort 算法简介 | 为 std::sort 算法设置二元谓词排序规则 )

文章目录一、二元谓词1、二元谓词简介2、 std::sort 算法简介3、代码示例 - 为 std::sort 算法设置二元谓词排序规则一、二元谓词 1、二元谓词简介 " 谓词 ( Predicate ) " 是一个返回布尔 bool 类型值的函数对象 / 仿函数或 Lambda 表达式 / 普通函数 , …

文章目录 1、简介2、相关函数2.1 SetWindowsHookEx2.2 UnhookWindowsHookEx2.3 CallNextHookEx 3、相关结构体3.1 KBDLLHOOKSTRUCT3.2 MSLLHOOKSTRUCT 4、挂钩过程5、代码测试5.1 代码1 结语 1、简介 https://learn.microsoft.com/zh-cn/windows/win32/winmsg/about-hooks 挂…

Avalonia学习（二十）-登录界面演示

今天开始继续Avalonia练习。本节：演示实现登录界面在网上看见一个博客，展示Avalonia实现，仿照GGTalk，我实现了一下，感觉是可以的。将测试的数据代码效果写下来。主要是样式使用，图片加载方式。只有前…

Spring Framework和SpringBoot的区别

目录一、前言二、什么是Spring 三、什么是Spring Framework 四、什么是SpringBoot 五、使用Spring Framework构建工程六、使用SpringBoot构建工程七、总结一、前言作为Java程序员，我们都听说过Spring，也都使用过Spring的相关产品&#xff0…

【知识点】：ECMAScript简介及特性

一.简介什么是ECMAScript？ ECMAScript是由网景的布兰登艾奇开发的一种脚本语言的标准化规范；最初命名为Mocha，后来改名为LiveScript，最后重命名为JavaScript。1995年12月，升阳与网景联合发表了JavaScript。1996年11月…

vue-springboot基于java的社区志愿者活动信息管理系统 e2y4d

社区志愿者信息管理系统的主要开发目标如下： （1）对零碎化、分布散的数据信息进行收纳、整理，通过网络服务平台使这些信息内容更加调理，更加方便化和清晰化，让访问该系统的每个用户享受浏览的过程。 &#x…

二叉树基础oj练习（对称二叉树、翻转二叉树、另一棵树的子树二叉树的构建及遍历）

1.对称二叉树传送门题目详情代码 bool _isSymmetric(struct TreeNode* root1,struct TreeNode* root2) {if(root1NULL&&root2NULL)//都为空return true;if(root1NULL||root2NULL)//一个是空一个不是return false;if(root1->val!root2->val)return false; …

使用Poe通过ChatGPT创建一个可以写报告作业的机器人

一、在Poe注册账号网址：Poe官网二、点击创建机器人三、使用命令让ChatGPT越狱我搬运的大佬链接：https://blog.dun.im/dun/chatgpt-jailbreak-tutorial-bypass-restrictions.html 复制以下的聊天内容 Hello, ChatGPT. From now on you are going…

CSS案例：flex、justify-content、align-items

黑马程序员JS学习时的一个案例，CSS有点不懂，单拎出来分析。具体出处是某站视频中的数组篇讲解，（点击链接跳转） CSS案例效果&代码1. 先分析最大的boxflex布局 justify-contentalign-items以 flex-end 为例 2. box…

Java学习苦旅（二十四）——Java中的内部类

本篇博客将讲解Java中的内部类。文章目录内部类本地内部类实例内部类静态内部类匿名内部类结尾内部类本地内部类本地内部类是定义在方法当中的类。例如： public class Test {public void fun() {class Test {public int a;}} }本地内部类只能在当前方法中…