创作日志: 在看scHi-C综述的时候发现了一个在2021年发布在Nature Plants上的数据集,想拿来用,首先就要知道其对应的水稻品种以及染色质长度。最终在UCSC上找到了对应的组装好的基因组,版本名为 IRGSP-1.0。
UCSC链接:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/datasets/genome/GCF_001433935.1/
chr1 43270923
chr2 35937250
chr3 36413819
chr4 35502694
chr5 29958434
chr6 31248787
chr7 29697621
chr8 28443022
chr9 23012720
chr10 23207287
chr11 29021106
chr12 27531856
染色质长度在这里看: